78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0006 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 151 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  69.54 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  49.02 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  45.22 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  44.74 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  45.39 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  44.37 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  45.83 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  41.06 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  43.33 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.95 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  41.61 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  39.6 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  43.07 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  38.16 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  43.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  37.58 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  37.58 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  38.46 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 		 185 aa  103  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  37.24 
 
 		 184 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.91 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  34.93 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  33.33 
 
 		 185 aa  87.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  33.81 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  35 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  28.15 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  26.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  24.29 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 115 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  25.17 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  36.99 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  36.99 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  27.27 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  24.11 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  27.41 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  24.82 
 
 		 118 aa  43.9  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  30.25 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  26.53 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  26.47 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  24.26 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  30.25 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  27.05 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  26.06 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  41.51 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  33.8 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  24.26 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  23.57 
 
 		 120 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  25.74 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  23.57 
 
 		 120 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  28.89 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  27.5 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  28.89 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  22.39 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  23.53 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  30.88 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  22.79 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  32.35 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  30.88 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  25.56 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  23.7 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>