23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0060 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  928    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  49.9 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  27.67 
 
 		 1356 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0714  hypothetical protein  82.14 
 
 		 167 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0513  hypothetical protein  79.31 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  23.59 
 
 		 870 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0886  hypothetical protein  80.65 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.03 
 
 		 1779 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0649  hypothetical protein  82.14 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  46.81 
 
 		 775 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  25.3 
 
 		 819 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2441  hypothetical protein  71.43 
 
 		 193 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  73.08 
 
 		 275 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.38 
 
 		 3324 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  39.83 
 
 		 5517 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.43 
 
 		 365 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2003  Ig-like protein  50 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0653567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  27.62 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.05 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  37.18 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  30.11 
 
 		 898 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  36.11 
 
 		 801 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>