37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0015 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  100 
 
 
50 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0096  30S ribosomal protein S14P  82 
 
 
50 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000254546  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  86.67 
 
 
47 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  75.56 
 
 
59 aa  73.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  66.67 
 
 
56 aa  67.4  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  68.89 
 
 
51 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  68.89 
 
 
51 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1764  ribosomal protein S14  54.55 
 
 
54 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.351928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  60.42 
 
 
56 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0224  ribosomal protein S14  80 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2232  ribosomal protein S14  80 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2306  30S ribosomal protein S14P  74.29 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2435  30S ribosomal protein S14P  75 
 
 
57 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  56.6 
 
 
53 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  56.6 
 
 
53 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1507  ribosomal protein S14  60 
 
 
53 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.59133e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  60 
 
 
53 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  56.82 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1842  ribosomal protein S14  72.22 
 
 
57 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  57.78 
 
 
53 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1864  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
54 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0177  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
54 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0241  30S ribosomal protein S14P  48.89 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1842  ribosomal protein S14  48.89 
 
 
54 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2010  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.866444  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0105  30S ribosomal protein S14P  48.84 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000005595  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1398  30S ribosomal protein S14P  48 
 
 
53 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1258  30S ribosomal protein S14P  47.73 
 
 
54 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11411  40S ribosomal protein S29 (Eurofung)  47.73 
 
 
56 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992589  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28147  predicted protein  53.19 
 
 
62 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0796  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
59 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.250712 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4131  ribosomal protein S14  58.33 
 
 
65 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43539  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42310  Ribosomal protein S29, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.24 
 
 
56 aa  48.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.243143  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04290  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.546532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01300  ribosomal protein S14  60.61 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  60.61 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  55.88 
 
 
61 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>