35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0012 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  68.97 
 
 		 116 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  62.07 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  60.87 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  56.41 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  56.48 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  50.43 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  51.75 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  50.88 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  54.63 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  48.15 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  52.78 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  52.78 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  51.85 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  50.46 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  43.86 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  44.35 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  44.74 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  43.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  44.74 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  42.37 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  44.74 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  40.87 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  42.73 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.13 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  39.18 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  43.48 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  33.91 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  38.1 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  36.62 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  34.67 
 
 		 106 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>