More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0093 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0093  fumarate hydratase class II  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0224877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.57 
 
 		 472 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  51.19 
 
 		 464 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  47.5 
 
 		 461 aa  84.7  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  50 
 
 		 461 aa  84.3  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  48.24 
 
 		 456 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 474 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  47.62 
 
 		 465 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  46.91 
 
 		 482 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  45.68 
 
 		 463 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  44.44 
 
 		 463 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  46.91 
 
 		 463 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  49.41 
 
 		 460 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  46.25 
 
 		 463 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 463 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  48.15 
 
 		 459 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  49.41 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  54.12 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  46.34 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.09 
 
 		 467 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  48.15 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  44.3 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  46.34 
 
 		 463 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  45.68 
 
 		 463 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  49.38 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  45.68 
 
 		 478 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  47.62 
 
 		 463 aa  78.2  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  47.5 
 
 		 475 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  46.91 
 
 		 466 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  48.19 
 
 		 477 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  48.75 
 
 		 474 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  48.75 
 
 		 463 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  49.38 
 
 		 471 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  40.7 
 
 		 461 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  42.68 
 
 		 469 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  46.05 
 
 		 457 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  46.84 
 
 		 461 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  44.44 
 
 		 466 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  45.57 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  49.37 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  48.1 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  50.62 
 
 		 469 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  45.57 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  45.78 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 464 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  55.22 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  44.3 
 
 		 465 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  48.1 
 
 		 464 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  45.68 
 
 		 462 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  45.12 
 
 		 463 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  44.44 
 
 		 466 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  46.91 
 
 		 468 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  46.84 
 
 		 472 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  46.84 
 
 		 472 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  47.67 
 
 		 478 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  47.62 
 
 		 458 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  46.84 
 
 		 469 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  43.9 
 
 		 469 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  46.91 
 
 		 468 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.5 
 
 		 480 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 476 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  46.91 
 
 		 468 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  43.9 
 
 		 467 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  44.58 
 
 		 477 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 467 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 467 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 467 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  45 
 
 		 469 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 467 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  46.25 
 
 		 467 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  44.3 
 
 		 464 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  45.68 
 
 		 472 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  48.15 
 
 		 476 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  44.19 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  40.24 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  47.56 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  46.15 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  48.15 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  42.68 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  43.21 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  51.9 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  44.3 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  44.58 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.37 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  43.21 
 
 		 466 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  47.06 
 
 		 479 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4596  fumarate hydratase  45 
 
 		 463 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  46.91 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  45 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  47.5 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>