More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0004 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  72.15 
 
 		 238 aa  363  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  63.56 
 
 		 240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  61.6 
 
 		 236 aa  321  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  62.61 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  62.44 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  59.75 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  59.19 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  58.22 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  57.08 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  60.08 
 
 		 236 aa  298  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  57.08 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  56.12 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  58.82 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  53.04 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  46.41 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  43.98 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  44.81 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  45.8 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  41.35 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  45.38 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  44.12 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  42.68 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.28 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  43.1 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  41.77 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.46 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  41.22 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  40.16 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  40.16 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  43.27 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  38.53 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  39.91 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  38.68 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  42.11 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  41.26 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  38.94 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  38.94 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  38.94 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  41.94 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  39.51 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  35.17 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  41.52 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  38.31 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  39.69 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  36.82 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  41.92 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  36.97 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  38.86 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  38.68 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  37.1 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  38.6 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  35.62 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  37.24 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  37.85 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  39.13 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  40.1 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  39.37 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  37.19 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  41.32 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  38.97 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.24 
 
 		 287 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  42.07 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  37.61 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  40.11 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  40.29 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  40.99 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  36.71 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  42.47 
 
 		 281 aa  128  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  35.42 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  39.78 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  39.27 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>