More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0005 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 137 aa  280  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  72.99 
 
 		 136 aa  216  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  53.28 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  55.47 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  51.09 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  50.36 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  49.63 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  50.36 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  49.24 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  51.15 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  49.21 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  50.76 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  45.19 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  50.39 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  51.94 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  42.22 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  40.15 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  41.67 
 
 		 161 aa  120  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  41.61 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  42.34 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  40.97 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  40.91 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  41.41 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  38.24 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  38.24 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  38.24 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.46 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  36.64 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  38.71 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  39.39 
 
 		 163 aa  97.1  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  42.11 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  45.88 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  47.54 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  40 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  44.07 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  42.11 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  37.65 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  35.71 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  38.27 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  36.14 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  35.29 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  38.27 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  36.14 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  36.47 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  37.7 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  40.22 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  40.74 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  40.26 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  41.38 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  42.11 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  39.34 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  37.93 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  35.71 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  33.33 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  37.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  37.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  37.93 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  38.18 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  41.94 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  37.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  39.66 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  33.77 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  34.41 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  33.77 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  37.8 
 
 		 90 aa  57  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  38.27 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  38.27 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>