More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2222 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  82.73 
 
 		 141 aa  236  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  82.14 
 
 		 140 aa  236  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  89.36 
 
 		 141 aa  234  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  76.6 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  56.82 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  55.3 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  55.3 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  51.52 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  52.63 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  52.27 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  53.03 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  52.27 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  49.61 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  56.2 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  48.06 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  52.27 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  52.31 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  49.61 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  51.52 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  53.23 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  42.42 
 
 		 182 aa  123  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  48 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  45.19 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  45.19 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  44.7 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.46 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  42.86 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  41.22 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  42.42 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  47.62 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  48.24 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  47.62 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  44.94 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  46.43 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  46.43 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  46.43 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  43.37 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  45.24 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  45.24 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  44.05 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  38.64 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  43.04 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  43.68 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  36.67 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  44.05 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  44.05 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  44.83 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  42.53 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  37.97 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  37.97 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  39.53 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  39.24 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  42.53 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  40 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  39.29 
 
 		 91 aa  57  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  37.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  37.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  37.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>