More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1832 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 140 aa  286  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  82.01 
 
 		 141 aa  237  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  78.72 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  82.14 
 
 		 140 aa  220  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  80.85 
 
 		 141 aa  213  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  56.82 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  54.26 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  52.63 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  52.71 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  51.94 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  49.24 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  50.78 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  50.39 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  49.61 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  50.39 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  53.03 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  51.52 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  50.75 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  46.51 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  53.23 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  44.27 
 
 		 182 aa  126  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 		 161 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  46.21 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  48.8 
 
 		 187 aa  124  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  44.7 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  43.18 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  41.86 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  44.36 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  41.22 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  42.42 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  38.17 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  44.57 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  46.07 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  44.05 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  46.43 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  47.89 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  44.78 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  46.67 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  45.9 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  43.68 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  53.45 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  55.1 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  43.04 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  55.1 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  43.04 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  43.28 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  43.28 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  43.04 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  41.84 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  52 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  57.14 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  42.53 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  45.28 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  42.5 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  41.77 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  49.02 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  41.25 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  49.02 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  49.15 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>