More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0515 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  76.1 
 
 
160 aa  260  8e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  75.16 
 
 
159 aa  255  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  74.52 
 
 
158 aa  254  5e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  73.25 
 
 
158 aa  250  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  58.21 
 
 
140 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  54.23 
 
 
140 aa  160  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  56.43 
 
 
141 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  48.09 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  45.8 
 
 
161 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  45.8 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  47.73 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  45.8 
 
 
161 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  49.61 
 
 
141 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  48.8 
 
 
140 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  49.19 
 
 
141 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  45.45 
 
 
131 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  47.62 
 
 
136 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 
139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  47.62 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  46.27 
 
 
141 aa  114  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  48 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  41.67 
 
 
137 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  42.4 
 
 
136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  40.15 
 
 
182 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  47.01 
 
 
163 aa  108  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  41.04 
 
 
147 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  40.48 
 
 
137 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  47.62 
 
 
137 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  42.74 
 
 
142 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  42.86 
 
 
137 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  37.69 
 
 
137 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  39.23 
 
 
136 aa  94.4  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  44.19 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  48.1 
 
 
92 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
95 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
95 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  43.3 
 
 
97 aa  62.8  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 
91 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  40 
 
 
91 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  42.47 
 
 
95 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  42.47 
 
 
95 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  41.94 
 
 
94 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 
91 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 
92 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 
92 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  40.86 
 
 
94 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  44.3 
 
 
90 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  44.19 
 
 
94 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 
91 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  44.83 
 
 
91 aa  61.6  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  42.47 
 
 
90 aa  61.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 
91 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  47.76 
 
 
92 aa  60.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  47.69 
 
 
91 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  40.7 
 
 
91 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  39.36 
 
 
92 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  43.04 
 
 
91 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
92 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  48.75 
 
 
91 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 
90 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 
94 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
92 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  44.78 
 
 
90 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  38.95 
 
 
93 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  43.04 
 
 
90 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  41.43 
 
 
95 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  47.5 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  50.91 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
91 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  39.53 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  44.62 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  50.91 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  45 
 
 
91 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  44.3 
 
 
91 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  41.77 
 
 
92 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
89 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 
92 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  37.5 
 
 
92 aa  58.9  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  44.19 
 
 
91 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 
92 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 
92 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>