More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0222 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 
94 aa  130  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  69.66 
 
 
89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
93 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
93 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
91 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
93 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
98 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
98 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
98 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
96 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 
91 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  64.71 
 
 
94 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  58.82 
 
 
95 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  58.82 
 
 
95 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  66.27 
 
 
91 aa  121  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  63.86 
 
 
90 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
89 aa  120  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
93 aa  120  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  62.92 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 
93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  61.11 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  60.67 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  60 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  63.53 
 
 
93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  60.44 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  59.55 
 
 
94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  65.06 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  68.24 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 
92 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  60 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  60 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  60.67 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  63.53 
 
 
91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 
92 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  61.18 
 
 
93 aa  117  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 
92 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  67.07 
 
 
96 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 
92 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  62.65 
 
 
91 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  116  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 
93 aa  116  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  56.82 
 
 
93 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  60 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  61.45 
 
 
94 aa  115  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  61.8 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  57.65 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  61.18 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>