More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3158 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  87.64 
 
 		 92 aa  166  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  79.78 
 
 		 92 aa  157  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  78.41 
 
 		 88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  77.53 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 88 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  72.73 
 
 		 91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  70.45 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  70.45 
 
 		 93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  66.29 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  72.94 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  61.63 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  72.94 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  72.94 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 98 aa  127  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 94 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  63.95 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  62.35 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  64.04 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  61.63 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  62.5 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  61.18 
 
 		 98 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 99 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 95 aa  124  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 94 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  61.18 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  64.71 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 94 aa  121  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>