More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2292 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  87.76 
 
 		 98 aa  183  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  83.67 
 
 		 98 aa  179  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  86.73 
 
 		 98 aa  178  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  81.63 
 
 		 98 aa  175  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  82.65 
 
 		 98 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  80.81 
 
 		 99 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 94 aa  140  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  70.11 
 
 		 89 aa  137  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 93 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  68.09 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 93 aa  133  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 92 aa  133  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  71.43 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 94 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  65.48 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 93 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 94 aa  130  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 86 aa  130  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 88 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 92 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  63.95 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  61.96 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  65.06 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  58.06 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  68.67 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>