More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05735 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  190  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  86.96 
 
 		 92 aa  174  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  73.91 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  75.28 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  75.86 
 
 		 94 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  74.7 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  66.3 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 98 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  68.97 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 98 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 93 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  60.87 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  59.78 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  59.34 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  57.61 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  57.61 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  61.29 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 93 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  53.26 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  59.77 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  61.45 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  55.43 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  59.77 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  60.92 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>