More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16741 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  91.21 
 
 
91 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  91.21 
 
 
91 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  92.31 
 
 
91 aa  177  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  89.01 
 
 
91 aa  175  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  89.01 
 
 
92 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  89.01 
 
 
91 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  89.01 
 
 
91 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
92 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
92 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  77.17 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  150  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
93 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  73.56 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
93 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  69.23 
 
 
93 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
94 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
93 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  68.13 
 
 
93 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
93 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
93 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
94 aa  133  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
93 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  133  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
93 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  67.39 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  72.29 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  68.48 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  65.52 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  72.29 
 
 
94 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  66.3 
 
 
94 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  68.54 
 
 
94 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
94 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
94 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
94 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  70.45 
 
 
93 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  67.03 
 
 
92 aa  129  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 
94 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  62.64 
 
 
92 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
94 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>