More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1181 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
95 aa  197  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  95.79 
 
 
95 aa  189  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  87.37 
 
 
95 aa  179  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4919  ribosomal protein S19  87.5 
 
 
80 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  77.65 
 
 
94 aa  151  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  75.86 
 
 
93 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  78.82 
 
 
94 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  76.47 
 
 
94 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  148  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  76.47 
 
 
93 aa  147  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 
93 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  67.74 
 
 
94 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
94 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  75.58 
 
 
86 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  65.26 
 
 
95 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  73.81 
 
 
94 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  74.12 
 
 
94 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 
94 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  74.7 
 
 
90 aa  139  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
94 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  72.09 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  68.6 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  71.43 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  64.52 
 
 
93 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  74.39 
 
 
85 aa  137  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  71.26 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  137  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
93 aa  135  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
93 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 
92 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  65.12 
 
 
94 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
98 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
92 aa  133  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
98 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
94 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
98 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  64.52 
 
 
93 aa  130  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  64.21 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  61.05 
 
 
95 aa  127  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  68.67 
 
 
93 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  63.95 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  59.14 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
98 aa  127  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  62.35 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
99 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
93 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
93 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  61.63 
 
 
89 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
93 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  65.06 
 
 
94 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
93 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  123  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
93 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 
93 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
93 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
93 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  62.07 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 
92 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
91 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
92 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>