More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0719 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 		 94 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  79.79 
 
 		 94 aa  161  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  78.72 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  75.53 
 
 		 94 aa  156  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  74.47 
 
 		 94 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  74.47 
 
 		 94 aa  153  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  73.4 
 
 		 93 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  70.21 
 
 		 94 aa  151  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  70.21 
 
 		 94 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  78.82 
 
 		 95 aa  150  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  78.82 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  71.28 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 94 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  75.9 
 
 		 91 aa  147  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  80 
 
 		 95 aa  147  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  67.02 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  75 
 
 		 86 aa  143  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 94 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  77.22 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  68.42 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 93 aa  141  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 		 92 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 93 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 93 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  139  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  72.29 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 90 aa  137  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 93 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 95 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  64.84 
 
 		 93 aa  136  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.39 
 
 		 93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 98 aa  133  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 98 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 93 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 98 aa  133  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  130  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 95 aa  130  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 98 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  64.13 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  129  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  68.67 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  59.57 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>