More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1151 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  86.96 
 
 		 92 aa  174  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  78.16 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  70.11 
 
 		 88 aa  136  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  68.48 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 98 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 99 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  61.96 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  68.97 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  59.78 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  57.61 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  62.07 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  59.34 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  64.71 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  61.96 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>