More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1619 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  78.16 
 
 		 88 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  74.71 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  74.71 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  72.41 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 96 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  69.77 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  67.82 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.44 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 94 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  68.97 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  67.06 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  69.05 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 98 aa  124  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  64.71 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  65.12 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  67.82 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 98 aa  123  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 98 aa  123  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  72.62 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  69.05 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  69.05 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  63.95 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  59.77 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  62.79 
 
 		 86 aa  120  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  62.79 
 
 		 86 aa  120  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  68.67 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 92 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  68.97 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  62.35 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  63.1 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>