More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3064 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  96.7 
 
 
91 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  90.11 
 
 
91 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  90.11 
 
 
91 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  90.11 
 
 
91 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  91.21 
 
 
91 aa  174  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
91 aa  173  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
91 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  86.81 
 
 
92 aa  169  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 
91 aa  168  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 
91 aa  167  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 
91 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
91 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  79.78 
 
 
93 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
91 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  156  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  155  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  155  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  153  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
91 aa  153  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  153  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  76.92 
 
 
91 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 
90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  76.92 
 
 
92 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  150  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  76.4 
 
 
92 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  148  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000166272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  73.33 
 
 
90 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  147  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  74.44 
 
 
90 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  73.33 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  71.43 
 
 
93 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  70 
 
 
90 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
89 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>