More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1934 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  78.65 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  79.55 
 
 		 88 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  77.53 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  76.4 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  75 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  75.28 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  72.41 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 		 98 aa  141  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  70.11 
 
 		 98 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 		 98 aa  140  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  72.41 
 
 		 88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  76.19 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  70.11 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 99 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  69.32 
 
 		 93 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 86 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  67.42 
 
 		 93 aa  129  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  129  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.42 
 
 		 93 aa  129  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  70.45 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 		 86 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 98 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 98 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 98 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  67.82 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  64.04 
 
 		 94 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  64.04 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  62.5 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  61.8 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 91 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  67.44 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 94 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>