More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2853 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  186  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  94.12 
 
 
93 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 
92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  85.88 
 
 
93 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  85.88 
 
 
93 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  76.34 
 
 
93 aa  154  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  87.06 
 
 
93 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  77.27 
 
 
89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  77.78 
 
 
91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  73.4 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  74.44 
 
 
90 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
98 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
98 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
98 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  76.67 
 
 
90 aa  140  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  79.76 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  78.31 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  75.56 
 
 
91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  74.42 
 
 
95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  76.14 
 
 
92 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  73.86 
 
 
88 aa  135  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
90 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  71.11 
 
 
92 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  70.97 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  75.9 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
92 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  71.91 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  72.73 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  72.41 
 
 
87 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
93 aa  131  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  71.59 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 
93 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
90 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  131  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 
95 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  70 
 
 
91 aa  131  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
93 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
92 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>