More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0712 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  72.83 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  75 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 90 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 90 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 94 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  77.11 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  75.58 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  72.09 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 90 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  70.93 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 93 aa  130  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 90 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  64.13 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  64.13 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  67.82 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  63.64 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  63.33 
 
 		 90 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 90 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 98 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 94 aa  121  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  61.29 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  60.87 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  67.86 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>