More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0811 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  67.47 
 
 		 92 aa  121  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  67.47 
 
 		 94 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  65.06 
 
 		 91 aa  119  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  68.67 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  64.37 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  61.63 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  116  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 91 aa  116  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  67.47 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  61.36 
 
 		 91 aa  115  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  59.77 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  62.07 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  65.52 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  61.45 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  66.27 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  58.62 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  60.47 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  60.92 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  63.86 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  65.06 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  62.65 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  61.45 
 
 		 94 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 93 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 93 aa  113  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  66.27 
 
 		 93 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>