More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1230 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
96 aa  200  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  61.96 
 
 
94 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 
92 aa  130  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
95 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
95 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
94 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  63.95 
 
 
95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  69.14 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  69.14 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  58.7 
 
 
94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  59.78 
 
 
94 aa  127  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  69.51 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  69.51 
 
 
90 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
94 aa  125  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  60.87 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  67.07 
 
 
93 aa  124  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  60.87 
 
 
94 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  59.78 
 
 
94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  63.41 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  65.85 
 
 
93 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  68.29 
 
 
93 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  69.51 
 
 
91 aa  123  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  65.85 
 
 
93 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  67.9 
 
 
93 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  67.9 
 
 
93 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  61.36 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  63.41 
 
 
92 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  59.77 
 
 
93 aa  122  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 
94 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  69.05 
 
 
91 aa  122  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  64.2 
 
 
91 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  63.41 
 
 
92 aa  121  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  63.41 
 
 
92 aa  121  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  121  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  64.2 
 
 
93 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  58.95 
 
 
98 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
91 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  121  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  69.14 
 
 
93 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  62.96 
 
 
93 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  121  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  63.1 
 
 
86 aa  121  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  65.43 
 
 
93 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  64.2 
 
 
92 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
92 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  60 
 
 
94 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
89 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  63.41 
 
 
94 aa  120  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  67.86 
 
 
88 aa  120  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  60.98 
 
 
92 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
91 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
93 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  60.98 
 
 
93 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  67.07 
 
 
90 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  62.96 
 
 
93 aa  120  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  62.96 
 
 
91 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  63.41 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  62.96 
 
 
93 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
95 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  64.63 
 
 
95 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  62.2 
 
 
92 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  61.36 
 
 
97 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  68.29 
 
 
89 aa  120  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  65.48 
 
 
92 aa  120  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  62.96 
 
 
93 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  57.89 
 
 
98 aa  120  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>