More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1840 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  60.23 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  61.7 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  62.96 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  63.95 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  62.96 
 
 
88 aa  111  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  61.36 
 
 
94 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  61.7 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  61.7 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  61.7 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  59.34 
 
 
93 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  60.22 
 
 
93 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  57.95 
 
 
90 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  59.09 
 
 
92 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  56.38 
 
 
94 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  56.04 
 
 
93 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  61.7 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  55.43 
 
 
93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  57.14 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  59.14 
 
 
93 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  56.82 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
91 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 
95 aa  107  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  59.09 
 
 
93 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
91 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  58.43 
 
 
91 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
91 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 
91 aa  107  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
91 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  59.14 
 
 
92 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
93 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  57.83 
 
 
93 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  60 
 
 
94 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
92 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  56.52 
 
 
91 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  60.24 
 
 
92 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  56.52 
 
 
92 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  61.45 
 
 
93 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
93 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  58.82 
 
 
98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 
93 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  57.14 
 
 
91 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  58.82 
 
 
98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  58.82 
 
 
98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  57.95 
 
 
94 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  59.52 
 
 
93 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  57.83 
 
 
93 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  57.78 
 
 
91 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  57.14 
 
 
91 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  53.41 
 
 
93 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
90 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  56.98 
 
 
98 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  60.98 
 
 
87 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  59.09 
 
 
91 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  59.52 
 
 
96 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  55.91 
 
 
92 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  57.61 
 
 
91 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  52.27 
 
 
93 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  58.62 
 
 
92 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 
92 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  58.62 
 
 
92 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  55.91 
 
 
92 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  60.71 
 
 
93 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  52.75 
 
 
91 aa  104  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  57.83 
 
 
93 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 
98 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 
92 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  58.33 
 
 
88 aa  104  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  55.43 
 
 
95 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  55.43 
 
 
95 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 
89 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 
91 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  59.52 
 
 
86 aa  104  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  61.36 
 
 
95 aa  104  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>