More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0225 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 
141 aa  283  8e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  65 
 
 
160 aa  175  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  64.29 
 
 
159 aa  174  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  63.57 
 
 
158 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  62.86 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  55.15 
 
 
140 aa  153  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  52.59 
 
 
162 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  56.43 
 
 
187 aa  148  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  54.41 
 
 
140 aa  147  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  51.11 
 
 
161 aa  146  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 
161 aa  146  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  54.61 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  50.37 
 
 
161 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 
140 aa  142  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  54.74 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  49.63 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  52.21 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  52.21 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  52.59 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  52.59 
 
 
131 aa  131  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 
137 aa  130  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  54.01 
 
 
140 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  44.85 
 
 
182 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  49.63 
 
 
136 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  55.15 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  48.15 
 
 
139 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  48.53 
 
 
137 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  45.19 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  46.67 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40 
 
 
142 aa  106  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  45.99 
 
 
137 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  41.73 
 
 
163 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  53.33 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  48.78 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  52.24 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  52.24 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  46.07 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  53.97 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  45.12 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  53.23 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  46.25 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  53.62 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  44.94 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  47.56 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  52.24 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  49.4 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  40.62 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  53.62 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  53.62 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  46.58 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  51.43 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  53.95 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  53.95 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  47.5 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  55.22 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>