More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1791 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  100 
 
 
92 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  79.35 
 
 
92 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  156  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  154  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  146  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  72.22 
 
 
93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  144  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
90 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  71.74 
 
 
92 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
94 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  137  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  136  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  67.39 
 
 
92 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
92 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
91 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  133  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
90 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  67.44 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
90 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
92 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000166272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  67.39 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>