More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1618 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  189  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  81.52 
 
 
92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  160  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  77.17 
 
 
92 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
92 aa  156  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
92 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  77.17 
 
 
92 aa  153  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  153  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  77.17 
 
 
92 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 
92 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  75 
 
 
92 aa  144  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  77.17 
 
 
92 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
90 aa  133  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  68.13 
 
 
91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
93 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  63.04 
 
 
92 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
90 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  123  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  123  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  60.87 
 
 
92 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  61.96 
 
 
93 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 
92 aa  120  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  62.64 
 
 
91 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>