More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1912 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  191  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  96.74 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  93.48 
 
 		 92 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  90.11 
 
 		 92 aa  176  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  85.71 
 
 		 92 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  81.52 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  81.52 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  83.7 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  81.52 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  85.71 
 
 		 92 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 		 92 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 		 92 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 		 92 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 		 92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 		 92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 		 92 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 		 92 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 		 92 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  78.02 
 
 		 92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 		 92 aa  146  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  69.23 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 90 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 87 aa  133  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  66.3 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  65.56 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>