More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2530 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 		 92 aa  179  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 		 92 aa  179  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  89.13 
 
 		 92 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 		 92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 		 92 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 		 92 aa  168  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 		 92 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  167  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  82.61 
 
 		 92 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  81.52 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 		 92 aa  160  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  79.12 
 
 		 92 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 		 92 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 92 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 92 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  76.09 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  66.3 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  70.97 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  64.13 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  63.04 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  66.28 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  62.64 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  62.64 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  60.44 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>