More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1724 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  61.31 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  60.29 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  55.47 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  57.66 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  57.97 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  54.26 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  55.81 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  54.26 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  56.82 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  49.26 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  52.59 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  58.46 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  43.38 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  48.84 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  43.07 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  43.06 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  41.67 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  49.23 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  41.91 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  40.88 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  41.61 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  42.07 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  46.03 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  45.52 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  42.75 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  40.91 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  41.38 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  52.54 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  36.79 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  46.67 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  46.43 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  37.04 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  37.8 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  38.1 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  38.16 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  36.84 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  38.96 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  37.66 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  35.9 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  44.07 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  38.82 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  32.89 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  42.37 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  42.37 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  40.32 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  36.47 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  35.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  36.05 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  38.6 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  44.64 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  43.1 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4919  ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  44.23 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  37.29 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  40.68 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  37.66 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  37.66 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  43.1 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  37.66 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  47.27 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  42.11 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  48.94 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  35.44 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  41.67 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  37.84 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  39.66 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>