More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0771 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 		 92 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  60 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  63.64 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  63.64 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  63.53 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  59.09 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  61.8 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  64.29 
 
 		 86 aa  120  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 91 aa  120  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  60.23 
 
 		 91 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  65.06 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  62.5 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  57.95 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  62.5 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  61.36 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 91 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 91 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  60.87 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  57.3 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  60.71 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  58.43 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  57.14 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  62.65 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  57.95 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  61.18 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  60.71 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  59.34 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  61.18 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  55.06 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  56.18 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  61.63 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>