More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03840 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  100 
 
 
163 aa  336  7e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  67.79 
 
 
182 aa  209  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  63.5 
 
 
142 aa  189  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  61.11 
 
 
147 aa  185  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  57.89 
 
 
137 aa  161  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  48.72 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  48.72 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  50.88 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  45.19 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  48.25 
 
 
158 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  46.15 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  42.86 
 
 
139 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  39.29 
 
 
137 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  42.42 
 
 
140 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  44.44 
 
 
140 aa  104  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  41.73 
 
 
141 aa  104  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  38.46 
 
 
141 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  41.38 
 
 
136 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  47.01 
 
 
187 aa  98.2  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  39.39 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  37.14 
 
 
137 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  38.62 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  41.73 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  41.79 
 
 
131 aa  95.5  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  42.42 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  37.88 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  34.81 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  37.14 
 
 
137 aa  92  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  34.81 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  35.25 
 
 
161 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  35.25 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  37.24 
 
 
136 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  43.02 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  36.9 
 
 
92 aa  58.2  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57.4  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  41.3 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  40.22 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0608  30S ribosomal protein S19  34.94 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  40.22 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
92 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 
91 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0413  30S ribosomal protein S19  34.94 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  34.94 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
87 aa  54.7  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  37.93 
 
 
91 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  39.08 
 
 
92 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  37.93 
 
 
91 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  43.02 
 
 
92 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 
91 aa  54.3  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  35.11 
 
 
91 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  39.76 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0270  ribosomal protein S19  41.89 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  43.02 
 
 
92 aa  54.3  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  41.89 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  39.02 
 
 
91 aa  53.9  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  39.08 
 
 
92 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  38.82 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  44.93 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  42.17 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  39.19 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  39.02 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  43.53 
 
 
91 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 
92 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  43.53 
 
 
92 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  37.65 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  46.43 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  37.08 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  39.73 
 
 
89 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  38.1 
 
 
91 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  43.24 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  37.35 
 
 
96 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  41.18 
 
 
92 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  37.35 
 
 
91 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>