More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26849 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  65.07 
 
 		 182 aa  209  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  61.11 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  57.25 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  57.25 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  45.19 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  46.97 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  46.21 
 
 		 159 aa  115  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  46.97 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  42.18 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  39.01 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  41.22 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  38.81 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  39.55 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  44.7 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  40.46 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  41.54 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  41.26 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  39.16 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  41.43 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  38.93 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  38.46 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  38.46 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  40.91 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  38.17 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  38.64 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  36.64 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  37.4 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  39.26 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  39.69 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  40.3 
 
 		 187 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  35.88 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  40.23 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  43.18 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  42.35 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  41.03 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  34.62 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  37.93 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  38.82 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  40 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  41.18 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  39.24 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  38.04 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  35.9 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  41.18 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  40.7 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  37 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  40.51 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0608  30S ribosomal protein S19  33.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  37.65 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  36.47 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0409  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00176498  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0413  30S ribosomal protein S19  33.33 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  37.97 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>