More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0214 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  89.36 
 
 
140 aa  241  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  77.3 
 
 
141 aa  236  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  80.85 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  79.29 
 
 
141 aa  227  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  58.46 
 
 
136 aa  154  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 
137 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 
139 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  51.88 
 
 
137 aa  141  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  52.94 
 
 
137 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  55.38 
 
 
136 aa  140  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  52.31 
 
 
151 aa  141  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  51.94 
 
 
137 aa  140  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  47.73 
 
 
140 aa  136  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  46.97 
 
 
140 aa  134  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  44.76 
 
 
182 aa  130  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 
159 aa  130  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  50.75 
 
 
158 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  46.15 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  47.66 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  44.53 
 
 
162 aa  122  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  42.34 
 
 
161 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  42.34 
 
 
161 aa  120  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  43.07 
 
 
161 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  41.61 
 
 
160 aa  117  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  41.43 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  40.77 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.44 
 
 
142 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  44.2 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  41.73 
 
 
163 aa  105  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  46.43 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  38.89 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  42.25 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  44.05 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  44.94 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  42.35 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  40.91 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  44.19 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  40.48 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  43.68 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  40.96 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  40 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  44.57 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  42.53 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  42.7 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  39.24 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  39.74 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  40.74 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  44.62 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  42.7 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  37.97 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  40.96 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  40.96 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  39.77 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  36.71 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  40 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  36.71 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  36.71 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  42.17 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  41.18 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  52 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  38.82 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  41.67 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  40 
 
 
91 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  52 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  41.38 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  36.71 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  38.82 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  39.51 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  37.65 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  45.45 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>