More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66616 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  63.5 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  60.43 
 
 		 182 aa  187  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  57.25 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  58.39 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  43.31 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  44.53 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  40.44 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  41.04 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  40.46 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  41.27 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  41.73 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  40.41 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  40 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  42.75 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  40.94 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  42.97 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  38.17 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  40.46 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  40.56 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  36.24 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  40.46 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  37.4 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  38.17 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  40.44 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  42.74 
 
 		 187 aa  97.4  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  36.64 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  38.36 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  35.88 
 
 		 160 aa  95.9  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  37.59 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  34.35 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  35.62 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  32.88 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  40.54 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  41.79 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  48.39 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  48.39 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  47.17 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  42.65 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  38.82 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  40.62 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  46.03 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  42.68 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.24 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  45.31 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  43.9 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  38.46 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  38.75 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  44.93 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  35.06 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  50.94 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  39.19 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  40.58 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  43.48 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0270  ribosomal protein S19  44.26 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  37.36 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  39.19 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  40.85 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  39.24 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  40.58 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  40 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  41.07 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  43.48 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  37.84 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  37.8 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  41.18 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>