More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1281 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  100 
 
 
87 aa  181  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  86.21 
 
 
91 aa  157  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 
92 aa  141  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 
92 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 
92 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 
92 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  75.28 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
93 aa  135  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  135  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 
92 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 
92 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 
92 aa  133  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
95 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  70.11 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  74.71 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
91 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
91 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  71.59 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
91 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
95 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
96 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  70.45 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
94 aa  130  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  68.54 
 
 
90 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  71.43 
 
 
94 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
94 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  68.18 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
93 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
92 aa  127  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  67.42 
 
 
93 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
93 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  68.89 
 
 
93 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
92 aa  127  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 
92 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  64.77 
 
 
92 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>