More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1479 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  189  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
92 aa  158  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
95 aa  158  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
92 aa  158  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
92 aa  157  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
92 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 
92 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  81.72 
 
 
93 aa  157  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  78.89 
 
 
92 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  76.67 
 
 
93 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  75.28 
 
 
87 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  74.16 
 
 
91 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  71.91 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  71.91 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  68.89 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
94 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
93 aa  130  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
94 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  70.24 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 
98 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
94 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 
98 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 
98 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
94 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  68.89 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  64.13 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
92 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
93 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
93 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
94 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  69.66 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  69.66 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  68.54 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
93 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 
93 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  68.18 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
90 aa  124  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>