More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0295 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  84.44 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  81.11 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  82.22 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  81.11 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  80 
 
 		 92 aa  157  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  80.22 
 
 		 93 aa  153  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  150  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 92 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  77.11 
 
 		 94 aa  137  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  70.53 
 
 		 95 aa  137  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  74.7 
 
 		 94 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  68.09 
 
 		 94 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  74.7 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 93 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 93 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 87 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 		 93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 		 93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  72.62 
 
 		 86 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  68.18 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  68.89 
 
 		 93 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  72.29 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  68.18 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  63.64 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>