More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0599 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  100 
 
 
93 aa  189  9e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  81.72 
 
 
92 aa  157  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  82.8 
 
 
92 aa  156  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 
95 aa  153  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  147  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  146  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  141  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  141  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  72.41 
 
 
93 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.39 
 
 
94 aa  137  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  72.62 
 
 
95 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
94 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
94 aa  137  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
94 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
94 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  65.93 
 
 
94 aa  130  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
94 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 
93 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
94 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
94 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
95 aa  130  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
87 aa  128  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  69.05 
 
 
86 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.42 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  65.59 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  62.07 
 
 
93 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
92 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  64.37 
 
 
93 aa  124  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
91 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 
92 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
95 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
92 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  123  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
91 aa  123  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
86 aa  122  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  64.89 
 
 
92 aa  123  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  64.37 
 
 
93 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  61.29 
 
 
91 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>