More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0106 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 
136 aa  273  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  72.99 
 
 
137 aa  216  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  60.29 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  58.39 
 
 
137 aa  167  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  54.74 
 
 
137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  56.82 
 
 
140 aa  154  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  50.74 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  52.55 
 
 
137 aa  150  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  54.76 
 
 
151 aa  147  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  54.2 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  55.3 
 
 
140 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  45.83 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  45.83 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  46.72 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  46.38 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  45.14 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  49.63 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  47.66 
 
 
131 aa  124  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  54.26 
 
 
141 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  44.12 
 
 
158 aa  120  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  43.38 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  42.65 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  41.3 
 
 
140 aa  118  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  44.62 
 
 
160 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  42.4 
 
 
187 aa  107  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  38.64 
 
 
182 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  38.17 
 
 
147 aa  101  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  38.62 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  39.1 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  34.35 
 
 
142 aa  92  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  50.57 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  45.88 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  46.99 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  49.09 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  46.91 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  46.91 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  46.91 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  46.91 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  45.68 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  43.37 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  44.05 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  39.29 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  46.99 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  43.75 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  43.08 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  42.5 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  45.68 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  43.37 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  39.76 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  45.12 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  45.78 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  45.12 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  43.21 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  45 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  42.25 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  46.03 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  46.34 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  45.12 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  45.78 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  45.61 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  39.76 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  45.78 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  44.71 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  45.68 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  41.46 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  45.68 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  42.25 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  44.58 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  41.98 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>