More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0269 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  55.45 
 
 
99 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  63.29 
 
 
94 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  61.04 
 
 
94 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  52.38 
 
 
97 aa  105  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 
93 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  56.38 
 
 
98 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  58.23 
 
 
94 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  58.23 
 
 
94 aa  103  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  59.49 
 
 
94 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  55.7 
 
 
94 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
94 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  56.32 
 
 
93 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  51.69 
 
 
94 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  58.23 
 
 
92 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  56.1 
 
 
86 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
92 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
92 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  52.94 
 
 
85 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  55.7 
 
 
91 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  53.19 
 
 
98 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  52.13 
 
 
98 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  55.42 
 
 
95 aa  100  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
95 aa  100  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
95 aa  100  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  53.66 
 
 
88 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  54.26 
 
 
98 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  58.23 
 
 
95 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  52.27 
 
 
92 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  56.96 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
92 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  52.13 
 
 
98 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
92 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  49.41 
 
 
94 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
94 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  49.44 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  52.87 
 
 
93 aa  98.2  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  54.88 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  51.22 
 
 
95 aa  97.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  50.59 
 
 
95 aa  97.4  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
98 aa  97.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  48.24 
 
 
94 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  52.44 
 
 
95 aa  97.1  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  49.41 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  46.67 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  51.22 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  52.5 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  49.43 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  54.55 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  55.7 
 
 
93 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  48.24 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  49.41 
 
 
92 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  57.5 
 
 
92 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  48.86 
 
 
93 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
92 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  51.9 
 
 
93 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  54.43 
 
 
92 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  51.9 
 
 
93 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
93 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  56.25 
 
 
91 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  49.43 
 
 
93 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  49.43 
 
 
93 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  51.9 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  51.9 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  51.22 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  56.25 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  56.25 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 
92 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  51.22 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  45.78 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  55.81 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  57.5 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  50.63 
 
 
93 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
92 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  53.49 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  49.37 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
92 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 
92 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  54.43 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  49.38 
 
 
88 aa  92  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  47.25 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  50.63 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  53.16 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>