More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0016 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  77.69 
 
 		 130 aa  219  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  62.02 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  63.08 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  60 
 
 		 130 aa  180  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  60.77 
 
 		 130 aa  177  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  60 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  60 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  56.92 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  58.46 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  57.69 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  53.97 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  53.49 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  51.54 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  48.46 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  48.46 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  48.46 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  49.23 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  47.69 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.38 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  43.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  44.36 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  44.35 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  34.33 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  33.83 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  35.92 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  35.92 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  37.32 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  37.12 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  37.76 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  37.12 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  38.89 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  29.32 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  38.89 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  36.36 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  36.09 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  30.3 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  32.87 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  33.57 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  35.21 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  37.5 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  39.16 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  0.0000000067379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  35.66 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  32.64 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  37.76 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  33.08 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  35 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  30.43 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  36.96 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  35.66 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  28.26 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  35 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  33.57 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  32.41 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  31.47 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  32.62 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  33.78 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  33.78 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  28.99 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>