More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1924 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  70 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  70.99 
 
 		 132 aa  194  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  68.46 
 
 		 132 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  69.23 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  69.23 
 
 		 132 aa  190  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  69.77 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  68.46 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  64.89 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  49.62 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0334  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000103559  hitchhiker  0.000409506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>