More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1161 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  79.55 
 
 		 132 aa  224  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  78.79 
 
 		 132 aa  222  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  72.73 
 
 		 132 aa  206  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  71.97 
 
 		 132 aa  204  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  68.99 
 
 		 130 aa  193  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  68.94 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  68.46 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  65.15 
 
 		 132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  63.08 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  60 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  60 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  55.97 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  146  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  57.25 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 133 aa  140  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  54.69 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  54.69 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  53.49 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  51.16 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  51.94 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>