More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1932 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
132 aa  268  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  98.48 
 
 
132 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  98.48 
 
 
132 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  94.7 
 
 
132 aa  253  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 
132 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  60 
 
 
134 aa  164  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  57.69 
 
 
131 aa  163  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  163  9e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  60 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  161  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 
133 aa  160  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  159  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  54.55 
 
 
132 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  158  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  157  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 
133 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  156  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
131 aa  155  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
133 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
131 aa  153  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
136 aa  153  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 
130 aa  151  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  54.69 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  150  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
134 aa  150  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 
131 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
133 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
132 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
133 aa  150  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 
132 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
133 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  55.88 
 
 
136 aa  149  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
133 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  53.44 
 
 
131 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
133 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  51.52 
 
 
132 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
134 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
133 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
132 aa  146  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  146  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 
132 aa  146  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  48.48 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  48.48 
 
 
132 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>