More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  100 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  90.15 
 
 		 132 aa  238  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  84.85 
 
 		 132 aa  228  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  72.73 
 
 		 132 aa  203  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  62.88 
 
 		 132 aa  173  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  64.39 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  169  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  166  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  57.58 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  163  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  64.12 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  56.62 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101428  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000012409  unclonable  0.0000000000562401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000362987  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4530  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000014022  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  57.89 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  55.15 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  57.58 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>