More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0125 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  98.48 
 
 
132 aa  263  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  89.39 
 
 
132 aa  244  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  88.64 
 
 
132 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  87.12 
 
 
132 aa  239  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  78.79 
 
 
132 aa  228  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  78.03 
 
 
132 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  78.03 
 
 
132 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  75 
 
 
132 aa  214  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  77.27 
 
 
132 aa  213  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  77.86 
 
 
131 aa  212  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  73.48 
 
 
132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  75.38 
 
 
130 aa  210  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  75 
 
 
132 aa  210  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  74.24 
 
 
132 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  73.48 
 
 
132 aa  209  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  72.73 
 
 
132 aa  208  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  71.97 
 
 
132 aa  206  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  71.97 
 
 
132 aa  206  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  74.24 
 
 
134 aa  204  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  70.45 
 
 
132 aa  203  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  72.73 
 
 
132 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  66.67 
 
 
132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  71.43 
 
 
133 aa  196  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  70.99 
 
 
131 aa  192  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  69.7 
 
 
132 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 
132 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 
132 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  67.42 
 
 
132 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  65.67 
 
 
134 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  65.67 
 
 
134 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  64.18 
 
 
134 aa  176  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  62.88 
 
 
132 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  62.88 
 
 
132 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  64.89 
 
 
131 aa  174  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  64.18 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  62.88 
 
 
132 aa  170  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 
131 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  60.45 
 
 
136 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 
132 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 
133 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 
132 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  60.9 
 
 
132 aa  168  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  61.65 
 
 
132 aa  167  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  61.36 
 
 
132 aa  167  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  167  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  166  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  166  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  166  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  166  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  58.82 
 
 
136 aa  166  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  60.9 
 
 
132 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  60.9 
 
 
132 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  59.85 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  60.61 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  58.52 
 
 
135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 
134 aa  163  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  61.65 
 
 
132 aa  163  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  60.9 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  58.39 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  59.23 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  57.04 
 
 
135 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  60.31 
 
 
130 aa  161  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  58.33 
 
 
132 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  161  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  59.26 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  58.52 
 
 
135 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
133 aa  159  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  159  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  58.33 
 
 
132 aa  159  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  58.09 
 
 
135 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
132 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 
133 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 
130 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>