More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1354 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  57.78 
 
 
136 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  57.04 
 
 
132 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
131 aa  150  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  52.99 
 
 
134 aa  151  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
131 aa  150  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  52.59 
 
 
132 aa  150  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
131 aa  150  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  54.07 
 
 
132 aa  149  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  52.59 
 
 
132 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  54.07 
 
 
132 aa  148  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 
132 aa  146  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  52.59 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  52.55 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  52.59 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  51.13 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
130 aa  144  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
135 aa  144  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  53.33 
 
 
131 aa  144  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 
132 aa  144  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  52.59 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  49.63 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  51.85 
 
 
132 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  51.82 
 
 
132 aa  143  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  52.21 
 
 
136 aa  143  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  143  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  50.36 
 
 
133 aa  142  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
131 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
131 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
131 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  140  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  140  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  48.12 
 
 
133 aa  140  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  140  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  140  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  51.85 
 
 
132 aa  140  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  51.45 
 
 
132 aa  140  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  51.85 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  137  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  48.53 
 
 
136 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
130 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 
134 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  46.67 
 
 
132 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  48.89 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  49.63 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 
131 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  49.63 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  46.32 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  52.24 
 
 
131 aa  135  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
132 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 
135 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>